Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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