Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
E2F4Q16254 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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