Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
USF2Q15853 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USF2Q15853 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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