Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHHQ15465 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHHQ15465 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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