Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NKX1-1Q15270 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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