Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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PTPRKQ15262 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRKQ15262 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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