Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
R3HDM1Q15032 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms