Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms