Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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