Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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COL4A6Q14031 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL4A6Q14031 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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