Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CAPSQ13938 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CAPSQ13938 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms