Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CDH18Q13634 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CDH18Q13634 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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CDH18Q13634 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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