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| PTK7 | Q13308 | RFFL-202 | ENST00000394597 | 4227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.81 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | KBTBD8-201 | ENST00000417314 | 4680 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.81 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | DPY19L2P2-203 | ENST00000435536 | 1858 nt | BASIC | 5.81 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | KCNC4-201 | ENST00000369787 | 18750 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.81 | □□□□□ -1.48 | | |
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| PTK7 | Q13308 | SLC26A7-208 | ENST00000523719 | 2902 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.81 | □□□□□ -1.48 | | |
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| PTK7 | Q13308 | GOLPH3L-201 | ENST00000271732 | 2999 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC092447.5-201 | ENST00000429367 | 2741 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC104964.3-201 | ENST00000606115 | 2860 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | IKZF2-201 | ENST00000342002 | 3747 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | DCTN4-201 | ENST00000424236 | 4054 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
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| PTK7 | Q13308 | COPB2-205 | ENST00000507777 | 3034 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC092111.3-201 | ENST00000402465 | 496 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | CCDC126-203 | ENST00000410069 | 890 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RN7SKP60-201 | ENST00000516985 | 239 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC026371.1-201 | ENST00000551867 | 419 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | SRD5A3-AS1-204 | ENST00000592823 | 542 nt | TSL 5 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | EAF1-AS1-207 | ENST00000599742 | 772 nt | TSL 5 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL450472.3-201 | ENST00000615578 | 367 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | TMEM212-205 | ENST00000619900 | 585 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | uc_338.7-201 | ENST00000621834 | 124 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC00706-201 | ENST00000628989 | 699 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | EXPH5-201 | ENST00000265843 | 10187 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | PNPT1P2-201 | ENST00000456768 | 2050 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | OPRM1-215 | ENST00000520708 | 1519 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | DYNC1I2-225 | ENST00000508530 | 2494 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | CNKSR2-202 | ENST00000379510 | 5315 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL360270.2-201 | ENST00000562952 | 5985 nt | BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC090337.1-201 | ENST00000579651 | 2074 nt | BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | LMO3-201 | ENST00000261169 | 3810 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | KERA-201 | ENST00000266719 | 2162 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | GTDC1-202 | ENST00000344850 | 2607 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |
| PTK7 | Q13308 | LZIC-201 | ENST00000377213 | 945 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.78 | □□□□□ -1.48 | | |