Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NR1H3Q13133 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NR1H3Q13133 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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