Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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GRIK2Q13002 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK2Q13002 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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