Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms