Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
J3QW42 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
J3QW42 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms