Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC61Q9Y6R9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms