Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WASHC2CQ9Y4E1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
WASHC2CQ9Y4E1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms