Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms