Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHANK2Q9UPX8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHANK2Q9UPX8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms