Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SETD1BQ9UPS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETD1BQ9UPS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms