Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD4Q9ULV1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD4Q9ULV1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms