Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED23Q9ULK4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED23Q9ULK4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms