Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GPATCH8Q9UKJ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPATCH8Q9UKJ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms