Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIMS3Q9UJD0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms