Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD8

SEPT9, Septin-9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT9Q9UHD8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEPT9Q9UHD8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEPT9Q9UHD8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms