Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLIP2Q9UDT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLIP2Q9UDT6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms