Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNF7Q9UBF6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF7Q9UBF6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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