Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLAIN2Q9P270 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLAIN2Q9P270 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms