Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP1Q9NZI2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNIP1Q9NZI2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms