Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms