Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATAD3AQ9NVI7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATAD3AQ9NVI7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms