Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX15Q9NRS6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms