Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms