Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX2Q9NRD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms