Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms