Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPCPD1Q9NPB8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms