Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC17Q9NP64 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC17Q9NP64 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms