Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1LQ9HCJ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms