Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CIPCQ9C0C6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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