Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA4CQ9C0C4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA4CQ9C0C4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms