Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXQ1Q9C009 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms