Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms