Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF559Q9BR84 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms