Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8Q99708 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms