Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIK3R4Q99570 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms