Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK5RAP2Q96SN8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms