Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LMTK3Q96Q04 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms