Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC74BQ96LY2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC74BQ96LY2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms